MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeromonas salmonicida salmonicida A449 plasmid pAsa3

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004924	CG	3	6	5	10	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004924	GGC	2	6	17	22	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004924	GAA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32453770
4	NC_004924	CTTGG	2	10	330	339	0 %	40 %	40 %	20 %	32453770
5	NC_004924	AAG	2	6	364	369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32453771
6	NC_004924	GCG	2	6	420	425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453771
7	NC_004924	ATG	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453771
8	NC_004924	TG	4	8	519	526	0 %	50 %	50 %	0 %	32453771
9	NC_004924	TTG	2	6	551	556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32453771
10	NC_004924	TGG	2	6	588	593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453771
11	NC_004924	AGTT	2	8	595	602	25 %	50 %	25 %	0 %	32453771
12	NC_004924	ACTG	2	8	609	616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_004924	ACA	2	6	631	636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_004924	GAT	2	6	637	642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004924	ATC	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_004924	ATTAA	2	10	683	692	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004924	TTA	2	6	703	708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004924	TA	4	8	750	757	50 %	50 %	0 %	0 %	32453778
19	NC_004924	A	7	7	777	783	100 %	0 %	0 %	0 %	32453778
20	NC_004924	AG	3	6	843	848	50 %	0 %	50 %	0 %	32453778
21	NC_004924	TGG	2	6	850	855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453778
22	NC_004924	G	6	6	854	859	0 %	0 %	100 %	0 %	32453778
23	NC_004924	TA	3	6	917	922	50 %	50 %	0 %	0 %	32453778
24	NC_004924	AT	3	6	966	971	50 %	50 %	0 %	0 %	32453778
25	NC_004924	GT	3	6	983	988	0 %	50 %	50 %	0 %	32453778
26	NC_004924	ATG	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453778
27	NC_004924	TTC	2	6	1019	1024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32453778
28	NC_004924	AGC	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453778
29	NC_004924	GCT	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453778
30	NC_004924	CAAT	2	8	1162	1169	50 %	25 %	0 %	25 %	32453778
31	NC_004924	ACC	2	6	1195	1200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453778
32	NC_004924	CCA	2	6	1240	1245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453778
33	NC_004924	TGT	2	6	1281	1286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32453778
34	NC_004924	TTC	2	6	1291	1296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32453778
35	NC_004924	CTT	2	6	1297	1302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32453778
36	NC_004924	CT	3	6	1306	1311	0 %	50 %	0 %	50 %	32453778
37	NC_004924	A	6	6	1317	1322	100 %	0 %	0 %	0 %	32453778
38	NC_004924	ATA	2	6	1340	1345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004924	GAG	2	6	1358	1363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004924	CA	3	6	1397	1402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_004924	AGC	2	6	1435	1440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004924	G	9	9	1458	1466	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004924	A	6	6	1669	1674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004924	AG	3	6	1818	1823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004924	AT	3	6	1858	1863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004924	CGC	2	6	1962	1967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453772
47	NC_004924	GAT	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453772
48	NC_004924	GCT	2	6	1997	2002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453772
49	NC_004924	CCGC	2	8	2006	2013	0 %	0 %	25 %	75 %	32453772
50	NC_004924	CGC	3	9	2053	2061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453772
51	NC_004924	AGG	2	6	2116	2121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453772
52	NC_004924	GGC	2	6	2246	2251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453772
53	NC_004924	TGG	2	6	2334	2339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453772
54	NC_004924	GGC	2	6	2408	2413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453772
55	NC_004924	CGC	2	6	2421	2426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453772
56	NC_004924	CGG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453772
57	NC_004924	CGTG	2	8	2477	2484	0 %	25 %	50 %	25 %	32453772
58	NC_004924	GGC	2	6	2515	2520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453772
59	NC_004924	GGC	2	6	2595	2600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453772
60	NC_004924	CCG	2	6	2671	2676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453772
61	NC_004924	GAG	2	6	2701	2706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453772
62	NC_004924	G	6	6	2724	2729	0 %	0 %	100 %	0 %	32453772
63	NC_004924	CGT	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453772
64	NC_004924	GTGA	2	8	2893	2900	25 %	25 %	50 %	0 %	32453772
65	NC_004924	GA	4	8	2965	2972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004924	GCT	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453773
67	NC_004924	CGCC	2	8	3098	3105	0 %	0 %	25 %	75 %	32453773
68	NC_004924	CAC	2	6	3120	3125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453773
69	NC_004924	TCCA	2	8	3168	3175	25 %	25 %	0 %	50 %	32453773
70	NC_004924	CTG	2	6	3213	3218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453773
71	NC_004924	GCT	2	6	3232	3237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453773
72	NC_004924	AGCC	2	8	3440	3447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_004924	CA	3	6	3525	3530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_004924	A	6	6	3530	3535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004924	ACC	2	6	3570	3575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453774
76	NC_004924	CCG	3	9	3601	3609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453774
77	NC_004924	GA	3	6	3616	3621	50 %	0 %	50 %	0 %	32453774
78	NC_004924	AGGCGG	2	12	3622	3633	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	32453774
79	NC_004924	G	6	6	3661	3666	0 %	0 %	100 %	0 %	32453774
80	NC_004924	CAA	2	6	3681	3686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32453774
81	NC_004924	AGCG	2	8	3709	3716	25 %	0 %	50 %	25 %	32453774
82	NC_004924	CAA	2	6	3782	3787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32453774
83	NC_004924	CTG	2	6	3897	3902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453774
84	NC_004924	GCC	3	9	3911	3919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453774
85	NC_004924	C	6	6	3918	3923	0 %	0 %	0 %	100 %	32453774
86	NC_004924	CACGG	2	10	3970	3979	20 %	0 %	40 %	40 %	32453775
87	NC_004924	CA	3	6	4024	4029	50 %	0 %	0 %	50 %	32453775
88	NC_004924	G	6	6	4061	4066	0 %	0 %	100 %	0 %	32453775
89	NC_004924	CGG	2	6	4082	4087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453775
90	NC_004924	CAG	2	6	4108	4113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
91	NC_004924	AGC	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
92	NC_004924	GAC	2	6	4186	4191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
93	NC_004924	GGA	2	6	4224	4229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453775
94	NC_004924	GTGCAT	2	12	4273	4284	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	32453775
95	NC_004924	GAC	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
96	NC_004924	CA	3	6	4471	4476	50 %	0 %	0 %	50 %	32453775
97	NC_004924	AGC	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
98	NC_004924	ACC	2	6	4499	4504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453775
99	NC_004924	GTG	2	6	4528	4533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453775
100	NC_004924	TGA	2	6	4542	4547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453775
101	NC_004924	AGC	2	6	4710	4715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
102	NC_004924	GCT	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453775
103	NC_004924	GCG	2	6	4800	4805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453775
104	NC_004924	AAGG	2	8	4832	4839	50 %	0 %	50 %	0 %	32453775
105	NC_004924	CAG	2	6	4856	4861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
106	NC_004924	ACG	2	6	4866	4871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
107	NC_004924	GAGG	2	8	4897	4904	25 %	0 %	75 %	0 %	32453775
108	NC_004924	GCT	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453775
109	NC_004924	GGGGT	2	10	4979	4988	0 %	20 %	80 %	0 %	32453775
110	NC_004924	CAG	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
111	NC_004924	GGA	2	6	5134	5139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453775
112	NC_004924	CAT	2	6	5152	5157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32453775
113	NC_004924	CAA	2	6	5282	5287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32453775
114	NC_004924	GCA	3	9	5311	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
115	NC_004924	GAG	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453775
116	NC_004924	CAGCG	2	10	5449	5458	20 %	0 %	40 %	40 %	32453775
117	NC_004924	CAG	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
118	NC_004924	GC	3	6	5517	5522	0 %	0 %	50 %	50 %	32453775

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.